Сколковский институт науки и технологий осуществляет свою образовательную деятельность в соответствии с федеральными государственными образовательными стандартами высшего образования (ФГОС ВО).
Сколковский институт науки и технологий при проектировании образовательных программ использует европейские стандарты (Standards and Guidelines for Quality Assurance in the European Higher Education Area) и международные стандарты в области инженерного образования CDIO.