Магистерские программы Сколтеха сочетают освоение научных знаний с практическими исследованиями и выполнением проектов с элементами инноваций. Структура учебного модуля предусматривает обучение дисциплинарным и теоретическим основам в течение шести недель, после которых одна неделя отводится на оценивание. На последующей неделе курса студенты выполняют уникальные проекты, предназначенные для развития креативности и позволяющие студентам, разрабатывая новые подходы, решать конкретные инженерные задачи в предметной области.