Под руководством профессора и директора Проектного центра омиксных технологий и передовой масс-спектрометрии Сколтеха Евгения Николаева научная группа займётся разработкой новой методологии и аппаратуры для идентификации и количественного анализа изомерных веществ с помощью методов ионной подвижности и тандемной масс-спектрометрии. Проект будет осуществляться совместно с Университетом Нинбо в Китае. В рамках проекта планируется разработать принципиально новые технические и инструментальные решения для распознавания изомеров молекул и их хиральности.

«Мы давно дружим с отдельными членами команды Университета Нинбо и имеем с ними совместные публикации. Профессор Динг Чуан-Фан директор Института масс-спектрометрии Университета Нинбо и его команда — это высококлассные специалисты в области масс-спектрометрии и структурного анализа биомолекул. Обе наши команды активно работают в области молекулярного и структурного анализа биомолекул, а также в направлении разработок новых типов масс-спектрометров и масс-спектрометрических методов анализа. В рамках проекта будут разработаны новые методы ионизации и  анализа изомерных веществ, которые  будут использоваться в диагностике ряда патологий, таких как, например, накопление токсичных изоформ белков и пептидов при старении и деменции, так и для контроля качества продукции в фармацевтической индустрии», — поделился Евгений Николаев.

Старший научный сотрудник Проектного центра омиксных технологий и передовой масс-спектрометрии Сколтеха Алексей Кононихин получил грант на совместное с Шанхайским институтом медицины и фармакологии исследование методом высокопроизводительной протеомики плазмы крови для выявления биомаркеров хронических заболеваний печени, которые часто имеют бессимптомное начало, что затрудняет их раннюю диагностику. Основная цель проекта — создание и внедрение новых технологий высокоэффективного протеомного анализа плазмы крови для поиска и мониторинга биомаркеров хронических заболеваний печени на ранних стадиях. 

«Мы были очень рады, что наш проект победил. Большую роль сыграло то, что в Сколтехе появился департамент по работе с Китаем, и мы благодарны Нинг Фу за помощь в организации двусторонних связей. Основной нашей задачей является поиск биомаркеров в плазме крови, что является одной из наиболее сложных задач в протеомике, поскольку разброс концентраций для некоторых белков может достигать 10-12 порядков. Благодаря сотрудничеству с командой профессора Ху Чжоу у нас будет возможность использовать самые передовые технологии для фракционирования и выравнивания концентраций белков плазмы крови, что позволит провести наиболее широкий поиск потенциальных биомаркеров. Далее на стадии валидации ключевых биомаркеров будут применяться методы прецизионной и количественной масс-спектрометрии с использованием наборов изотопно-меченных пептидных стандартов, которые наша команда активно развивает», — прокомментировал Алексей Кононихин.

Доцент Центра энергетических технологий Сколтеха Станислав Федотов получил грант на фундаментально-ориентированный проект, направленный на исследование перспективных электродных материалов для низкотемпературных натрий-ионных аккумуляторов. Работа будет проведена совместно с Университетом Сучжоу. Основная задача — с помощью синхротронных методов и мегасайенс-установок детально исследовать физико-химические процессы, протекающие внутри натрий-ионных аккумуляторов: в объёме и на поверхности электродных материалов, а также на границах раздела при низких температурах в режиме реального времени.

«Фокус проекта — не просто на наблюдении, а на глубоком понимании этих процессов с целью научиться управлять ими. Работа строится на принципах комплементарности: наши партнёры, имеющие обширный опыт синхротронных исследований, сосредоточатся на изучении механизмов электрохимических реакций, а мы на основании полученных знаний предложим способы модификации активных материалов и ячеек для более эффективной работы при низких температурах», — подчеркнул Станислав Федотов.

Старший преподаватель и руководитель Лаборатории анализа метагеномов Центра молекулярной и клеточной биологии Сколтеха Артём Исаев получил грант на совместное с Фуданьским университетом исследование роли анти-CRISPR механизмов в распространении антибиотико-устойчивых плазмид среди бактерий Klebsiella pneumoniae. Госпитали по всему миру сталкиваются с проблемой антибиотикоустойчивости. Гены устойчивости к антибиотикам часто распространяются плазмидами — мобильными формами ДНК. В норме такие «миграции плазмид» контролируются иммунными системами бактерий, например CRISPR-Cas.

«В последние годы в Китае наблюдается рост числа заражений антибиотико-устойчивыми формами Klebsiella pneumonia, и связано это в частности с тем, что некоторые плазмиды научились эффективно подавлять CRISPR-Cas иммунитет бактерий. В то время как наша лаборатория обнаружила такие анти-CRISPR белки в ходе биоинформатического анализа, наши коллеги работают при госпитале и очень часто замечают анти-CRISPR гены в клинических изолятах, полученных от пациентов. Интересно здесь то, что для подавления CRISPR-системы требуется сразу два белка ингибитора, которые вероятно действуют совместно друг с другом. В рамках проекта мы объединим клиническую и фундаментально-научную экспертизу, чтобы понять механизмы ингибирования CRISPR-Cas систем плазмидными белками и разработать стратегии контроля подобных плазмид», — поделился Артём Исаев.

Размер одного гранта со стороны РНФ составит от 4 до 7 миллионов рублей ежегодно. Гранты выделены на осуществление научных исследований в 2026–2028 годах. Полный список победителей доступен на сайте фонда.