Сколковский институт науки и технологий предлагает программы образования уровня магистратуры и аспирантуры. Ключевыми результатами обучения станут компетенции, знания, навыки и способы действия в области научных исследований, предпринимательства и инноваций. Образовательные программы Сколтеха сосредоточены в пяти областях (секторах) знаний и компетенций, соответствующих приоритетным направлениям проекта «Сколково»: информационные технологии, энергетические технологии, биомедицинские технологии, космические технологии и новые производственные технологии.

Каждый из секторов связан с  Центрами науки, инноваций и образования (ЦНИО) Института, которые обеспечивают междисциплинарные научные исследования, разработку инновационных проектов и реализацию образовательных программ на основе сотрудничества с индустрией, ведущими ВУЗами России и мира в соответствии с международными стандартами инженерного образования.

Образование в Сколтехе обеспечит выпускникам Института:

• прочные знания и компетенции в области передовых технологий и инновационной деятельности.
• знание и опыт в разработке  междисциплинарных проектов.
• понимание социального контекста науки и технологий, собственной ответственности за принятие инженерных решений.
• системное мышление и опыт решения сложных задач в изменяющихся условиях.
• понимание инноваций и предпринимательства как связующего звена науки, технологии и бизнеса.