Центр коллективного пользования передовой масс-спектрометрии

snimok-ekrana-2020-02-26-v-13-22-05

Центр коллективного пользования передовой масс-спектрометрии создан в Сколтехе в марте 2019 г.  ЦКП включает оборудование, необходимое для проведения широкого спектра масс-спектрометрических измерений в области протеомики и метаболомики и анализа органических соединений. Приборной базой для выполнения работ являются масс-спектрометры высокого разрешения Q-exactive (ThermoScientific), Q-TOF TIMS Pro, Q-TOF impact (Bruker) и MALDI-TOF/TOF Rapiflex (Bruker), а также вспомогательное оборудование для проведения пробоподготовки и программное обеспечение для анализа результатов измерений.

Масс-спектрометрия является мощным инструментом исследования структуры химических соединений. Благодаря современным инструментальным разработкам масс-спектрометрия позволят проводить высокопроизводительный анализ тысяч белков или низкомолекулярных соединений в одном эксперименте.

В ЦКП работает команда высококвалифицированных профессионалов, которые являются экспертами проведения хроматомасс-спектрометрического анализа и биоинформационной обработки результатов в области метаболомных и протеомных исследований.

Основной задачей ЦКП является обеспечение работ по масс-спектрометрическим исследованиям для лабораторий Сколтех, а также и предоставление сервиса для сторонних пользователей.

bez-zagolovka

ЦКП предоставляет широкий спектр услуг, включающий:

Протеомные исследования по идентификации, характеристике и количественной оценке белков
1. MALDI-TOF, MALDI-TOF-TOF анализ
2. ESI-MS, LC-MS и LC-MS/MS анализ
3. Таргетный анализ – LC-SRM-MS (Selected reaction monitoring, parallel reaction monitoring (PRM))
4. Количественные протеомные измерения с использованием изотопномеченных меток или стандартов, а также без использования меток
5. De-novo секвенирование пептидов
6. MS и LC/MS анализ целых белков и их комплексов
7. Пробоподготовка (фракционирование, удаление высокопредставленных белков, гидролиз белков и др.)

Метаболомные исследования
1. Хромато-масс-спектрометрическое профилирование метаболома, липидома
2. Метаболомный анализ клинических образцов

Биоинформатический анализ масс-спектрометрических данных
1. Идентификация белков, идентификация природы и локализации пост-трансляционных модификаций белков, количественный анализ белков

Пакетная услуга по подтверждению структурной идентичности белковых препаратов
1. Подтверждение идентичности более 95% первичной последовательности
2. Картирование S-S
3. Определение природы и сайтов гликозилирования белков
4. Определение модификаций белка (окисление метионинов, дезаминирование)
5. Набор отчетной документации

Пакетная услуга по определению первичной структуры белков (De-novo секвенирование белков)
1. Масс-спектрометрическое определение массы целого белка
2. Оптимизация гидролиза и гидролиз белка набором протеаз
3. LC-MS/MS анализ гидролизатов белков
4. De novo секвенирование пептидов
5. Сборка последовательности с использованием оригинального программного обеспечения
6. Выборочная верификация результатов методом секвениронания по Эдману
7. Набор отчетной документации

Руководитель ЦКП: д.б.н. Згода Виктор Гаврилович

По всем вопросам, связанным с заказом услуг и сотрудничеством, просьба писать по адресу:

Документы
1. Приказ о создании ЦКП передовой масс-спектрометрии
2. Список оборудования
3. Перечень услуг и тарифы
4. Регламент оказания услуг
5. Шаблон договора оказания услуг